I laboratori svolgono attività di ricerca e di consulenza scientifica in settori affini per contenuti e/o per strumenti e metodi e attività di formazione istituzionale e professionale del CGT per i rispettivi settori di competenza.

Il CGT è organizzato in dieci laboratori:

Laboratorio di Web Services e Web Mapping Coordinatore : Daniele Simoncini Responsabile : Lorenzo Martinelli	Laboratorio di Rilevamento Geotematico e Geopedologia Responsabile : Ivan Callegari
Laboratorio di Idrogeologia Applicata e Ambientale Responsabile : Enrico Guastaldi	Laboratorio di GIS e Cartografia Digitale Responsabile : Altair Pirro
Laboratorio di Geotecnologie per l'Archeologia Responsabile : Marta Caterina Bottacchi	Laboratorio di Geomorfologia Applicata Responsabile : Filippo Bonciani
Laboratorio di Geomatica Responsabile : Leonardo Disperati	Laboratorio di Geofisica e Geofisica Applicata Responsabile : Tommaso Colonna
Laboratorio di Analisi Fisico-Meccaniche delle Terre e delle Rocce Responsabile : Assunta Sfalanga	Gruppo di lavoro CGT-LaMMa Responsabile : Andrea Rindinella